一、本所收容少年健保醫療由台南市立醫院(委託秀傳醫療社團法人經營)團隊承作，安排內科、牙科、精神科及公益健檢門診。

二、定期辦理收容少年愛滋病篩檢、胸部X光檢查與公費流感疫苗（含職員）注射。 

三、定期辦理收容少年及職員衛生教育宣導及CPR急救訓練，提升醫療保健及救護相關知能。

四、與台南市立醫院精神科合作辦理社工個別協談服務，每週二下午由該院社工師來所進行收容期間之個別協談、諮商輔導，促進少年出所後之社會生活適應、家庭關係改善、成癮問題戒治，期藉此達到真正、積極地問題解決。

五、舍房、教室、候見室及職員備勤室等處環境消毒工作。  

六、不定期清掃、消毒水溝及修剪樹木、草叢等措施減少蚊蟲藏匿點，以杜絕蟲害。房、教室等處環境消毒工作。